Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://hdl.handle.net/10596/6782

Título : Identificación de sitios en proteínas usando máquinas con vectores de soporte
Autor: Bobadilla, Jaime Leonardo
Mojica, Tobías
Niño, Luis Fernando
Editorial : Universidad_Nacional_Abierta_y_a_Distancia
Fecha: 2003-07-01
Idioma: spa
es
Palabras Clave: Aprendizaje de m·quinas
Anotaciones
Estructura de proteÌnas
Sitios
Algoritmos
No- sitios
Biología Molecular
Ciencias Biólogicas
Escuela: Departamento de Ingeniería de Sistemas, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá
Instituto de Genética
Universidad Nacional de Colombia, Bogotá.
Formato: pdf
application/pdf
Tipo de Recurso Digital: Journal
info:eu-repo/semantics/article
Descripción del contenido : Ante el incremento creciente de estructuras tridimensionales (3D) de proteínas determinadas por rayos X y tecnologías de NMR, así como de estructuras obtenidas mediante métodos computacionales, resulta necesaria la utilización de métodos automatizados para obtener anotaciones iniciales. Hemos desarrollado un nuevo método para reconocer sitios en estructuras tridimensionales de proteínas. Este método está basado en un algoritmo previamente informado para crear descripciones de microambientes proteicos, utilizando propiedades físicas y químicas muy específicas. El método de reconocimiento tiene 3 entradas: 1. Un juego de sitios que comparten alguna función estructural o funcional; 2. Un juego de sitios que no comparten funciones estructurales o funcionales; 3. Un solo sitio para análisis. Una máquina clasificadora con vector de soporte utiliza detalles del vector, donde cada componente representa una propiedad en volumen dado. La validación contra tests independientes muestra que esta prueba de reconocimiento tiene una alta sensibilidad y especificidad. También describimos los resultados de examinar 4 proteínas de unión a calcio (y con el calcio removido) utilizando una rejilla tridimensional de puntos de prueba en un espacio de 1.25Ao. Nuestros resultados muestran que descripciones basadas en propiedades con máquinas de soporte de vectores pueden ser utilizadas para el reconocimiento de sitios de proteínas en estructuras no anotadas.
URL: reponame:Repositorio Institucional de la Universidad Nacional Abierta y a Distancia
instname:Universidad Nacional Abierta y a Distancia
URI : http://hdl.handle.net/10596/6782
Relación del contenido: Biología Molecular
Ciencias Biológicas
ISSN : 2462-9448
Aparece en las colecciones: Revista : NOVA Vol.1 N.1 2003

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