Characterization and analysis of the genetic variability of mulberry (Morus spp) accessions using microsatellite markers

Trochez, Julián David; Paz, Iván Enrique; Almanza, Martha; Ruiz, Ximena

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DC Field	Value	Language
dc.creator	Trochez, Julián David	es
dc.creator	Paz, Iván Enrique	es
dc.creator	Almanza, Martha	es
dc.creator	Ruiz, Ximena	es
dc.date	2023-12-19	-
dc.identifier	https://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/riaa/article/view/6555	-
dc.identifier	10.22490/21456453.6555	-
dc.description	Contextualization: The analysis of genetic diversity is essential to preserve and adequately harness genetic resources, both plant and animal, and it is transcendental for developing selection and improvement strategies to obtain promising materials. Knowledge gap: There are few studies of characterization and analysis reported of genetic variability for mulberry Morus spp. in Colombia and need to be developed in order to provide information that enables refining and optimizing the management, use, and conservation of the available germplasm, contributing to the recovery and harnessing of these genetic resources’ potential. Purpose: The research aimed to genetically characterize the mulberry, Morus spp., collection of the Cauca region sericulture project using microsatellite markers. Methodology: 36 accessions belonging to the mulberry collection conserved at the Centro de Estudios Vegetales La Rejoya (Center for Plant Studies La Rejoya in English) of Universidad del Cauca were evaluated using ten microsatellites fluorescently labeled. The diversity and genetic structure parameters were evaluated. Additionally, the genetic relationships were determined through a cluster analysis. Results and conclusions: 49 alleles were detected, with a mean PIC of 0.57, indicating the use of polymorphic and informative markers. The population structure analysis with the Bayesian (STRUCTURE v 2.3.4) and grouping methods (Neighbor-joining and PCoA) indicated three discrete population groups with significant genetic differentiation of 22% (AMOVA - Fst; p<0.001). It highlighted the finding of nineteen different genotypes, suggesting the presence of a high number of duplicate materials that will have to be evaluated for the possible elimination of redundant resources in the germplasm bank.	en
dc.description	Contextualización: el análisis de diversidad genética es fundamental para conservar y aprovechar adecuadamente los recursos genéticos, tanto vegetales como animales, además trascendental para el desarrollo de estrategias de selección y mejoramiento para la obtención de materiales promisorios. Vacío de conocimiento: los estudios de caracterización y análisis de la variabilidad genética reportados para morera Morus spp en Colombia son pocos, por lo que es necesario su desarrollo a fin de proporcionar información que permita depurar y optimizar, tanto el manejo como el uso y la conservación del germoplasma disponible, aportando a la recuperación y aprovechamiento del potencial de estos recursos genéticos. Propósito: la investigación se orientó a caracterizar genéticamente la colección de morera Morus spp del proyecto de sericultura caucana empleando marcadores microsatélites. Metodología: se evaluaron 36 accesiones pertenecientes a la colección de morera conservada en el Centro de Estudios Vegetales de La Rejoya, Universidad del Cauca, utilizando 10 microsatélites marcados con fluorescencia. Se evaluaron parámetros de diversidad y estructura genética y, adicionalmente, se determinaron relaciones genéticas mediante un Análisis de Clúster. Resultados y conclusiones: fueron detectados 49 alelos, con un PIC medio de 0,57, indicando el empleo de marcadores polimórficos e informativos. El análisis de estructura poblacional con método bayesiano (STRUCTURE v 2.3.4) y el de agrupamiento (Neighbor-joining, PCoA) indicaron tres grupos poblacionales discretos, con una diferenciación genética significativa del 22% (AMOVA-Fst; p<0,001). Destacó el hallazgo de 19 genotipos diferentes, sugiriendo la presencia de un alto número de materiales duplicados que deberán ser evaluados para posible eliminación de recursos redundantes en el banco de germoplasma.	es
dc.format	application/pdf	-
dc.format	application/zip	-
dc.language	spa	-
dc.publisher	Sello Editorial UNAD	es
dc.relation	https://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/riaa/article/view/6555/6479	-
dc.relation	https://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/riaa/article/view/6555/7395	-
dc.relation	https://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/riaa/article/view/6555/7396	-
dc.relation	https://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/riaa/article/view/6555/7397	-
dc.relation	https://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/riaa/article/view/6555/7398	-
dc.rights	Derechos de autor 2023 Revista de Investigación Agraria y Ambiental	es
dc.rights	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0	es
dc.source	Revista de Investigación Agraria y Ambiental; Vol. 15 No. 1 (2024); 49-70	en
dc.source	Revista de Investigación Agraria y Ambiental; Vol. 15 Núm. 1 (2024); 49-70	es
dc.source	2145-6453	-
dc.source	2145-6097	-
dc.subject	diversidad genética	es
dc.subject	estructura poblacional	es
dc.subject	germoplasma	es
dc.subject	marcador molecular	es
dc.subject	sericultura	es
dc.subject	genetic diversity	en
dc.subject	population structure	en
dc.subject	germplasm	en
dc.subject	molecular marker	en
dc.subject	sericulture	en
dc.title	Characterization and analysis of the genetic variability of mulberry (Morus spp) accessions using microsatellite markers	en
dc.title	Caracterización y análisis de la variabilidad genética de accesiones de morera (Morus spp) empleando marcadores microsatélites	es
dc.type	info:eu-repo/semantics/article	-
dc.type	info:eu-repo/semantics/publishedVersion	-
dc.type	Área Agrícola	es
Appears in Collections:	Revista RIAA

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