• español
    • English
    • français
    • português
A+A-
  • English 
    • español
    • English
    • français
    • português
    • Usage guides
      • Guidelines for the advisor work direcor
      • Guidelines for the student who loads degree work
      • APA 7 Edition Standards
      • Tips APA 7 Edition Standards
    • Users
    View Item 
    •   National Open and Distance University UNAD
    • Producción Científica
    • Sello Editorial UNAD
    • Revista Nova
    • View Item
    •   National Open and Distance University UNAD
    • Producción Científica
    • Sello Editorial UNAD
    • Revista Nova
    • View Item
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS

    Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS

    Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS

    Thumbnail
    QRCode
    Share
    Author
    Cordeiro, Tiago
    Granados Acevedo, Catalina
    Pons, Miquel
    Publisher
    Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca

    Citación

           
    TY - GEN T1 - Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS T1 - Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS AU - Cordeiro, Tiago AU - Granados Acevedo, Catalina AU - Pons, Miquel UR - https://repository.unad.edu.co/handle/10596/29834 PB - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca AB - ER - @misc{10596_29834, author = {Cordeiro Tiago and Granados Acevedo Catalina and Pons Miquel}, title = {Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NSIncorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS}, year = {}, abstract = {}, url = {https://repository.unad.edu.co/handle/10596/29834} }RT Generic T1 Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS T1 Incorporación química de la sonda fluorescente FlAsH en la proteína Hha: aplicación al estudio del complejo Hha/H-NS A1 Cordeiro, Tiago A1 Granados Acevedo, Catalina A1 Pons, Miquel LK https://repository.unad.edu.co/handle/10596/29834 PB Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca AB OL Spanish (121)
    Bibliographic managers
    Refworks
    Zotero / EndNote / Mendeley
    BibTeX
    CiteULike
    Metadata
    Show full item record
    Abstract
    El objetivo de esta investigación fue realizar estudios de incorporación de la sonda FlAsH como posible herramienta para el estudio in vitro e in vivo de la proteína Hha y de su interacción con H-NS. Se construyó una proteína con la secuencia específica “CCPGCC” capaz de unir la sonda fluorescente FlAsH; posteriormente se desarrollaron procesos de transformación, expresión y purificación, con los cuales se evidenció que a pesar de introducir una secuencia adicional no nativa a la proteína, se pudo obtener proteína en buena cantidad, estabilidad, rendimiento y con un alto nivel de pureza. La optimización del protocolo de incorporación del FlAsH se hizo teniendo en cuenta el rendimiento y el tiempo de reacción. El complejo FlAsH/HhaCCPGCC se caracterizó mediante fluorescencia y se comprobó mediante MALDI TOF. La incorporación HhaCCPGCC1/ FlAsH no se obtuvo en un alto porcentaje como se esperaba, por esta razón no se pudieron hacer los estudios de interacción entre el complejo de proteínas Hha y H-NS.
     
    Chemical Incorporation of Fluorescent Probe FlAsH on the Hha Protein: Application to the Study of Complex Hha/H-NS The objective of this investigation was the development of studies of incorporation of the probe F1AsH as a possible tool for the study in vitro and in vivo of the protein Hha and the interaction with H-NS. A protein was constructed with the specific sequence “CCPGCC” able to join the fluorescent molecular probe FLAsH; later, processes of transformation, expression, and purification were developed, with which it was demonstrated that even with the introduction of an additional no native sequence in the protein, it could be obtain protein in a good amount, stability, yield and whit a high level of purity. The optimization of the protocol of incorporation of FLAsH was made considering the yield and the time of reaction. FLAsH was characterized with fluorescence and was verified with MALDI TOF. The incorporation HhaCCPGCC1/ FLAsH could not be obtained in a high percent as it was expected; therefore, the studies of interaction between the protein complex Hha and H-NS could not be done.
     
     
    College
    http://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/nova/article/view/412/1126
    /*ref*/Madrid C, Balsalobre C, García J, Juárez A. The novel Hha/YmoA family of nucleoid-associated proteins: use of structural mimicry to modulate the activity of the H-NS famil of proteins. Mol Microbiol. 2007;63:7 14.
    /*ref*/Varshavsky, A., Nedospasov, S. A., Bakayev, V. V., Bakayeva, T. G. and Georgiev, G. P. Histone-like proteins in the E. coli chromosome. Nucl. Acids Res. 1977:4: 2725-2745.
    /*ref*/Lammi M, Paci M, Pon CL, Losso MA, Miano A, Pawlik RT, et al. Proteins from the prokaryotic nucleoid: biochemical and 1H NMR studies on three bacterial histone-like proteins. Adv Exp Med Biol. 1984;179:467-477.
    /*ref*/Spassky A, Rimsky S, Garreau H, Buc H. H1a, an E. coli ADN-binding protein which accumulates in stationary phase, strongly compacts AND in Vitro. Nucleic Acids Res. 1984;12.5321-5340.
    /*ref*/Schröder O, Wagner R. The bacterial regulatory protein H-NS- -a versatile modulator of nucleic acid structures. Biol Chem. 2002;383:945-960.
    /*ref*/Pons I. La familia de proteínas Hha-YmoA: estudios estructurales y papel regulador en Yersinia Enterocolitica. Tesis Doctoral. Universitat de Barcelona, 2006.
    /*ref*/Azam TA, Ishihama A. Twelve species of the nucleoid-associated protein from Escherichia coli. Sequence recognition specificity and ADN binding affinity. J Biol Chem. 1999;274:33105-33113.
    /*ref*/Dorman CJ, Hinton JC, Free A. Domain organization and oligomerization among H-NS-like nucleoid associated proteins in bacteria. Trends Microbiol. 1999;7:124-128.
    /*ref*/Badaut C, Williams R, Arluison V, Bouffartigues E, Robert B, Buc H, Rimsky S. The degree of oligomerization of the H-NS nucleoid structuring protein is related to specific binding to ADN. J Biol Chem. 2002;277:41657-41666.
    /*ref*/Esposito D, Petrovic A, Harris R, Ono S, Eccleston JF, Mbabaali A, et al. H-NS oligomerization domain structure reveals the mechanism for high order self-association of the intact protein. J Mol Biol. 2002;324:841- 850.
    /*ref*/Bloch V, Yang Y, Margeat E, Chavanieu A, Augé MT, Robert B, et al. The H-NS dimerization domain defines a new fold contributing to AD recognition. Nat Struct Biol. 2003;10:212-218.
    /*ref*/Dorman CJ. H-NS: A universal regulador for a dynamic genome. Nat Rev Microbiol 2004;12:179-184.
    /*ref*/Godessart N, Muñoa FJ, Regue M, Juárez A. Chromosomal mutations that increase the production of a plasmid-encoded haemolysin in Escherichia coli. J Gen Microbiol. 1988;134:2779-2787.
    /*ref*/Yee A, Chang X, Pineda-Lucena A, Wu B, Semesi A, Le B, et al. An NMR approach to structural proteomics. Proc Natl Acad Sci U S A. 2002;99:1825-1830.
    /*ref*/Nieto JM, Madrid C, Miquelay E, Parra JL, Rodríguez S, Juárez A. Evidence for direct protein-protein interaction between members of the enterobacterial Hha/YmoA and H-NS families of proteins. J Bacteriol. 2002;184:629-635.
    /*ref*/Rodríguez S. Interacción entre proteínas de las familias H-NS y Hha / YmoA: regulación de la expresión génica en Enterobacteriaceae. Tesis Doctoral. Facultad de Biología. Universitat de Barcelona, 2005.
    /*ref*/Cordeiro T. Dynamic and structural aspects of the interaction between Hha and H-NS. Diploma of Avanced Studies in Organic Chemistry. Universitat de Barcelona- IRB- Barcelona Science Park, 2008.
    /*ref*/García J, Cordeiro TN, Nieto JM, Pons I, Juárez A, Pons M. Interaction between the bacterial nucleoid associated proteins Hha and H-NS involves a conformational change of Hha. Biochem J. 2005;388:755-762.
    /*ref*/Rimsky S. Structure of the histone-like protein H-NS and its role in regulation and genome superstructure. Curr Opin Microbiol. 2004;7:109- 114
    /*ref*/Cordeiro T. Insights into the Interaction between Nucleoid-associated Proteins, Hha and H-NS. Formal Training Report. Platform Biomolecular RMN , Barcelona Science Park, Universitat de Barcelona. 2005.
    /*ref*/Zhang J, Campbell RE, Ting AY, Tsien RY. Creating new fluorescent probes for cell biology. Nat Rev Mol Cell Biol. 2002;3:906-918.
    /*ref*/Stroffekova K, Proenza C, Beam KG. The protein-labeling reagent FLASH-EDT2 binds not only to CCXXCC motifs but also nonspecifically to endogenous cysteine-rich proteins. Pflugers Arch. 2001;442:859-866.
    /*ref*/Adams SR, Campbell RE, Gross LA, Martin BR, Walkup GK, Yao Y, New biarsenical ligands and tetracysteine motifs for protein labeling in vitro and in vivo: synthesis and biological applications. J Am Chem Soc. 2002;124:6063-6076.
    /*ref*/Fernández De Alba, C. Estudio de la interacción entre proteínas asociadas al nucleoide mediante anisotropía de fluorescencia. Máster en Química orgánica experimental. Universitat de Barcelona, Institut de Recerca Biomédica de Barcelona, 2007
    Format
    application/pdf
    Type of digital resource
    info:eu-repo/semantics/article
    info:eu-repo/semantics/publishedVersion
    info:eu-repo/article/published
    info:eu-repo/article/published
    info:eu-repo/article/published
    URI
    https://repository.unad.edu.co/handle/10596/29834
    URL source
    http://hemeroteca.unad.edu.co/index.php/nova/article/view/412
    http://dx.doi.org/10.22490/24629448.412
    Collections
    • Revista Nova [1177]
    Usage guidesNormativityGuidelines for the advisor work direcorGuidelines for the student who loads degree workAPA 7 Edition StandardsTips APA 7 Edition Standards

    Browse

    All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

    My Account

    LoginRegister
    GTM statisticsGTM statistics
    Indexed by:
    logo_Open Archives Initiative
    logo_Biblioteca Digital Ecuatoriana
    logo_OpenDOAR
    logo_Open ROAR
    logo_Google Scholar
    logo_Lyrasis
    logo_WorldCat
    logo_FAO
    logo_AGRIS
    logo_Alianza de Servicios de Información Agropecuaria
    logo_Siembra
    logo_Fedesarrollo
    logo_Colombia Digital
    logo_Hemeroteca UNAD
    logo_RED DE REPOSITORIOS LATINOAMERICANOS
    logo_OAIster
    logo_La Referencia
    logo_Open AIRE
    logo_Core
    logo_Base
    logo_CLACSO
    logo_OpenAlex
    logos isopreadGreat Work to PlaceIcontec - Great Work to Place

    Línea anticorrupción: 3232641617 ext. 1544

    En Bogotá D.C. (Colombia) Teléfono: 323 264 1617 - Línea gratuita nacional: 323 264 1617

    Institución de Educación Superior sujeta a inspección y vigilancia por el Ministerio de Educación Nacional

    Universidad Nacional Abierta y a Distancia UNAD de Colombia - © Copyright UNAD 2024

    Síguenos en: