Objetivo. Realizar el diagnóstico de la calidad bacteriológica del agua del Humedal Gualí-Tres Esquinas, por medio de indicadores de aguas residuales (coliformes totales, Escherichia coli y Enterococcus spp). Métodos. Se tomaron catorce muestras de agua de diferentes puntos del humedal (7 en la zona Tres Esquinas y 7 en la zona del parque industrial Cofradía). El recuento de microorganismos se realizó por el método de filtración de membrana siguiendo el Standard Methods, los microrganismos fueron identificados mediante BBL Crystal. Resultados. El agua del Humedal Gualí-Tres Esquinas contiene un alto número de E.coli, coliformes totales y Enterococcus spp., lo que confirma la contaminación de origen fecal en todo el ecosistema, los recuentos más altos se encontraron en la zona parque industrial La Cofradía para coliformes totales y Enteroccocus spp. y en la zona de Tres Esquinas para E. coli.Objetive. To evaluate the bacteriological quality of the water of the wetland Gualí-Tres Esquinas, using residual waters indicators (total coliforms, Escherichia coli and Enterococcus). Methods. Fourteen water samples were taken from different points of the wetland (7 in the Tres Esquinas zone and 7 in the Cofradía industrial park zone). The count of microorganisms was made by the membrane filtration method following the Standard Methods, the microorganisms were identified by BBL Crystal. Results. The water of the Gualí-Tres Esquinas Wetland contains a high number of E. coli, total coliforms and Enterococcus spp., confirming fecal contamination throughout the ecosystem, the highest counts were found in the La Cofradía industrial park zone for total coliforms and Enteroccocus spp. and in the Tres Esquinas zone for E. coli.