Una alternativa para disminuir la contaminación ambiental generada por el empleo de sustancias químicas cuando se extraen metales pesados en la industria minera, así como los costos en materiales químicos es utilizar en este proceso microorganismos que han demostrado realizar esta actividad, denominados biolixiviadores. Para ello es necesario identificar y fenotipificar estos microorganismos. El objetivo de este proyecto fue aislar y fenotipificar microorganismos biolixiviadores obtenidos de cuatro minas de esmeraldas del departamento de Boyacá (Muzo, Coscuez, Chivor y Consorcio). El muestreo se realizó en agua y roca, hábitat principal de las bacterias que participan en los procesos de biolixiviación. El aislamiento se realizó previa preparación de cada una de las muestras, las cuales se sembraron en el medio de cultivo 9K, líquido y sólido, e incubaron por siete días a 37°C. Se evidenciaron cambios físicos en la intensidad de color y en el aspecto en los medios de cultivo, lo que permite presumir que ha ocurrido alguna acción de las bacterias lixiviantes sobre los compuestos del medio. La observación microscópica evidenció la presencia de bacilos gram negativos y cristales.Por otra parte, se confirmó la característica de ser bacterias acidófilas ya que su desarrollo se obtuvo a pH entre 1 y 2,5. Los resultados obtenidos en este estudio permitieron concluir que en estas minas hay presencia de organismos bacterianos con morfología y comportamiento bioquímico compatible con bacterias biolixiviantes del género Thiobacillus. El aislamiento y fenotipificación obtenidos in vitro abre la posibilidad de establecer un método óptimo para su conservación y posterior utilización en procesos de bioremediación.An alternative to diminish the environmental contamination generated by the use of chemical substances when heavy metals in the mining industry as well as the costs in chemical equipments are extracted is to use in this process microorganisms that have demonstrated this activity, denominated bioleaching. For this, is necessary to identify and to phenotyping these microorganisms. The objective of this project was to isolate and to phenotype obtained bioleaching microorganisms of four emerald mines of the department of Boyacá (Muzo, Coscuez, Chivor and Consorcio). The sampling was made in water and rock, main habitat of the bacteria that participate in the Bioleaching processes. The isolation was made previous preparation of each one of the samples, which seeded in culture means 9K, liquid and solid, and incubated by seven days to 37°C. showing physical changes in the color intensity and the aspect in culture means, which allows to be conceited that it has happened some action of the leaching bacteria on compounds of means. The microscopic observation demonstrated the presence of gram negative bacilli and crystals.On the other hand, the characteristic of being was confirmed acidophilic bacteria since its development was obtained to pH between 1 and 2,5. The results obtained in this study allowed to conclude that in these mines there is presence of bacterial organisms with morphology and compatible biochemical behavior with biolixiviantes bacteria of the Thiobacillus sort. The obtained isolation and fenotipificación in vitro open the possibility of establishing an optimal method for its conservation and later use in bioremediation processes.