La ciénaga Mata de Palma, ubicada en el departamento del Cesar, Colombia, está siendo afectada por las diferentes actividades productivas que se realizan en la zona, lo que ha alterado la función del ecosistema. Este humedal presenta agotamiento y degradación debido a la deforestación, a la entrada de aguas residuales, a la modificación de los regímenes hidráulicos y al uso de métodos inadecuados de explotación de peces, que agotan los recursos naturales y causan pobreza en la población.Cuando se utiliza como medio de eliminación de excretas y otros desechos orgánicos, el agua es una fuente de transmisión de numerosos microorganismos, entre los que prevalecen los de origen intestinal. Es por esta razón que el control sanitario se realiza en función de la presencia de los coliformes totales, coliformes fecales y Enterococcus. Desde el punto de vista microbiológico, el examen de la calidad sanitaria del agua tiene por objetivo determinar la presencia de ciertos grupos de bacterias, que revelen una contaminación por materia fecal o por materia orgánica. Los recuentos de los indicadores de contaminación fecal mostraron que el agua no es apta para el consumo humano ni para uso recreativo. En esta ciénaga se identificaron una gran variedad de microorganismos que muestran la diversidad bacteriana que puede ser utilizada en biotecnología y en la indicación biológica, y de interés sanitario, pues afectan la salud humana y la de otros organismos.The Mata de Palma wetland, located in the department of Cesar, Colombia, is being affected by the different productive activities that are performed in the area, which has altered ecosystem function. This represents wetland depletion and degradation due to deforestation, entry of waste water, changing water regimes and the use of inappropriate methods of exploitation of fish, which deplete natural resources, causing poverty in the population. When used as a means of disposal of excreta and other organic wastes, water is a source of transmission of many microorganisms, prevailing those of intestinal origin. It is for this reason that health checks are done based on the presence of total coliform, fecal coliform and Enterococcus. From the microbiological point of view, consideration of the sanitary quality of water is designed to determine the presence of certain groups of bacteria, which are indicative of fecal contamination or organic matter. The counts of faecal pollution indicators showed that the water is unfit for human consumption or for recreational use. In this swamp were identified a variety of microorganisms that show bacterial diversity, which can be used in biotechnology and biological indication and medical interest, as they affect human health and other organisms.