La producción de biocombustibles y bioproductos utilizando microalgas puede realizarse con tratamientos térmicos para producir biocrudo, o mediante la extracción y transformación de metabolitos específicos. Esta última alternativa incluye las etapas de cultivo, cosecha, secado, extracción de lípidos y purificación o transformación de los mismos. La factibilidad técnica y económica de la obtención de bioproductos derivados del aceite de microalgas depende en gran medida de la eficiencia de extracción de los lípidos. El objetivo principal de este trabajo es establecer una metodología para la disrupción celular y extracción soxhlet de aceite de microalgas, y determinar su efectividad en tres cepas nativas; Amphiprora, Desmodesmus y Tetraselmis. Se evaluó el efecto de distintos métodos de disrupción celular como MSA, MHA, HA4M Fast, y HA0.5M Slow,solventes como hexano, ciclohexano y metanol, y tiempos de extracción de 4,6 y 8 horas, sobre la cantidad de aceite extraído. La mayor eficiencia de extracción se obtuvo utilizando disrupción celular MSA. El mejor solvente fue hexano y el mejor tiempo de extracción fue de 8 horas.