Dentro de las funciones de evaluación, control y seguimiento ambiental de los usos de las fuentes de agua existentes en el Cesar por parte de la Corporación Autónoma Regional del Cesar- CORPOCESAR, se realizó un estudio para evaluar la calidad de aguas subterráneas ubicadas en 93 aljibes en los municipios de La Paz y San Diego (Cesar) en 2009 de acuerdo con lo estipulado en el decreto 1575/07 y la resolución 2115/07 del Ministerio de Protección Social y el Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial. Se caracterizaron propiedades microbiológicas (determinación de Pseudomona aeruginosa y protozoos patógenos) y fisicoquímicas (conductividad, pH, temperatura, sólidos disueltos totales, salinidad, acidez, alcalinidad, turbidez, cloruros, amonio, nitritos, nitratos, hierro, magnesio, sodio y calcio, estos tres últimos análisis necesarios para calcular la aptitud para riego con el fin de evidenciar la calidad del agua de la que se abastecen los habitantes de estos predios). La detección de P. aeruginosa se realizó mediante filtración por membrana y protozoos mediante la técnica de flotación por centrifugación con sulfato de zinc. De las muestras analizadas en un 84,94% se encontró P. aeruginosa. Se identificaron 5 géneros de protozoos siendo Giardia sp el patógeno con mayor prevalencia, representando un 46,1%, seguido de Criptosporidium sp con un 22,18%; en relación con los resultados fisicoquímicos, estos indicaron que de los aljibes muestreados solo un 4,3% contienen agua apta para riego sin que su uso acarree riesgos para la salud.Among the functions of evaluation, the control and environmental monitoring of the uses of existing water sources in Cesar was studied by the Corporación Autónoma Regional del Cesar, CORPOCESAR, to evaluate the quality of groundwater located in 93 wells in the municipalities of La Paz and  San Diego (Cesar) in 2009 in accordance with decree 1575/07 and resolution 2115/07 of the Ministerio de Protección Social (Ministry of Social Protection) and the Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial (Ministry of Environment, Housing and Territorial Development). Were characterized microbiological properties (determined from Psuedomona aeruginosa and protozoan pathogens) and physiochemical properties (conductivity, pH, temperature, total dissolved solids, salinity, acidity, basicity, turbidity, chlorides, ammonia, nitrites, iron, magnesium, sodium and calcium; the last three elements being necessary for the calculation of the viability of irrigation, with the end of quantifying the quality of the water supplying the inhabitants of these lands). The Detection of P. aeruginosa was achieved via filtration through a membrane and protozoa through the flotation technique by centrifugation with zinc sulfate. Of the samples analyzed, 84.94% contained P. aeruginosa. Were identified five genera of protozoa, Giardia sp being the pathogen of highest prevalence at 46.1 %, followed by Cryptosporidium sp at 22.18%. Respecting the physiochemical results, only 4.3% of the wells sampled were determined to be suitable for irrigation without jeopardizing public health and safety.